特記ない場合は、SFC版、PS2版共通です。本棚の本はアイテムではありませんが、一応記述してます。
赤字はPS2版で追加ないし変更された要素です。

■船 (スタート時点)

▼おたから (SFC版)

B1F
タンス	やくそう

▼おたから (PS2版)

B1F
タンス(左)	まもりのたね
タンス(右)	やくそう
甲板(左舷)
タル	やくそう
甲板(左舷後方)
タル	すごろくけん
船長室
本棚	モンスターだじゃれ全集「いっかくうさぎを いつか食う」
船倉B2F
タル	やくそう／すごろくけん
宝箱	カギがかかっていて開かない
特別室
タンス	やくそう

▼その他
■船長と船倉地下2Fの右側にいる船員と話をして甲板へ戻ると、港へ到着する。
■フローラとの出会いイベントあり (PS版)
■港到着後、パパスと話をすると先へ進む